In mancanza dei treni, è stata messa a disposizione anche la navigazione sui battelli per spostarsi sul lago. Trenord ha collaborato con Navigazione Laghi per istituire dieci corse tra Lierna, Varenna e Bellano e quattro tra Varenna e Lierna. Questa è una delle misure predisposte per far fronte alla mancanza della linea ferroviaria, interrotta in seguito alla frana.
Le partenze da Bellano verso Lierna saranno alle 7.15, 9.15, 12.45, 15.15 e 17.15. Da Lierna a Bellano, i battelli partiranno alle 8.30, 11.30, 14.00, 16.05 e 19.00. Inoltre, ci saranno due ulteriori corse da Varenna verso Lierna alle 11.15 e alle 18.30 e da Lierna a Varenna alle 10.50 e alle 18.00.
La tratta Bellano-Varenna richiederà 17 minuti di percorrenza, mentre la tratta Varenna-Lierna richiederà 23 minuti. L’intero tragitto sarà percorso in 40 minuti. Le stazioni ferroviarie di Bellano e Lierna distano circa dieci minuti dai pontili di imbarco. Inoltre, insieme ai bus sostitutivi, i battelli saranno un’alternativa per gli spostamenti nella zona del lago.